Glavne smeri zdravljenja miokarditisa z zdravili so določene z glavnimi členi patogeneze miokarditisa: vnetjem, ki ga povzroči okužba, neustreznim imunskim odzivom, smrtjo kardiomiocitov (zaradi nekroze in progresivne distrofije, miokarditične kardioskleroze) in motenim metabolizmom kardiomiocitov. Upoštevati je treba, da se pri otrocih miokarditis pogosto pojavi na ozadju kronične fokalne okužbe, ki postane neugodno ozadje (zastrupitev in senzibilizacija telesa) in prispeva k razvoju in napredovanju miokarditisa.